RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
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Namespace List
Namespace Members
All
Functions
Variables
Typedefs
Enumerations
Enumerator
_
a
b
c
d
e
f
g
h
i
k
l
m
n
o
p
q
r
s
t
u
v
w
x
y
z
Here is a list of all namespace members with links to the namespace documentation for each member:
- c -
C :
RDKit::Drawing
calcAMW() :
RDKit::Descriptors
calcAngleBendEnergy() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcAngleBendGrad() :
ForceFields::MMFF::Utils
,
ForceFields::UFF::Utils
calcAngleForceConstant() :
ForceFields::MMFF::Utils
,
ForceFields::UFF::Utils
calcAngleRestValue() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcBondForceConstant() :
ForceFields::MMFF::Utils
,
ForceFields::UFF::Utils
calcBondRestLength() :
ForceFields::MMFF::Utils
,
ForceFields::UFF::Utils
calcBondStretchEnergy() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcChi0n() :
RDKit::Descriptors
calcChi0v() :
RDKit::Descriptors
calcChi1n() :
RDKit::Descriptors
calcChi1v() :
RDKit::Descriptors
calcChi2n() :
RDKit::Descriptors
calcChi2v() :
RDKit::Descriptors
calcChi3n() :
RDKit::Descriptors
calcChi3v() :
RDKit::Descriptors
calcChi4n() :
RDKit::Descriptors
calcChi4v() :
RDKit::Descriptors
calcChiNn() :
RDKit::Descriptors
calcChiNv() :
RDKit::Descriptors
calcCosTheta() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcCrippenDescriptors() :
RDKit::Descriptors
calcEleEnergy() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcExactMW() :
RDKit::Descriptors
calcFractionCSP3() :
RDKit::Descriptors
calcHallKierAlpha() :
RDKit::Descriptors
calcInversionCoefficientsAndForceConstant() :
ForceFields::UFF::Utils
calcKappa1() :
RDKit::Descriptors
calcKappa2() :
RDKit::Descriptors
calcKappa3() :
RDKit::Descriptors
calcLabuteASA() :
RDKit::Descriptors
calcLipinskiHBA() :
RDKit::Descriptors
calcLipinskiHBD() :
RDKit::Descriptors
calcMolFormula() :
RDKit::Descriptors
calcMQNs() :
RDKit::Descriptors
calcNonbondedDepth() :
ForceFields::UFF::Utils
calcNonbondedMinimum() :
ForceFields::UFF::Utils
calcNumAliphaticCarbocycles() :
RDKit::Descriptors
calcNumAliphaticHeterocycles() :
RDKit::Descriptors
calcNumAliphaticRings() :
RDKit::Descriptors
calcNumAmideBonds() :
RDKit::Descriptors
calcNumAromaticCarbocycles() :
RDKit::Descriptors
calcNumAromaticHeterocycles() :
RDKit::Descriptors
calcNumAromaticRings() :
RDKit::Descriptors
calcNumHBA() :
RDKit::Descriptors
calcNumHBD() :
RDKit::Descriptors
calcNumHeteroatoms() :
RDKit::Descriptors
calcNumHeterocycles() :
RDKit::Descriptors
calcNumRings() :
RDKit::Descriptors
calcNumRotatableBonds() :
RDKit::Descriptors
calcNumSaturatedCarbocycles() :
RDKit::Descriptors
calcNumSaturatedHeterocycles() :
RDKit::Descriptors
calcNumSaturatedRings() :
RDKit::Descriptors
calcOopBendEnergy() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcOopBendForceConstant() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcOopChi() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcPathDiscriminators() :
RDKit::Subgraphs
calcPEOE_VSA() :
RDKit::Descriptors
calcSlogP_VSA() :
RDKit::Descriptors
calcSMR_VSA() :
RDKit::Descriptors
calcStbnForceConstants() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcStretchBendEnergy() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcTorsionCosPhi() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcTorsionEnergy() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcTorsionForceConstant() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcTorsionGrad() :
ForceFields::MMFF::Utils
,
ForceFields::UFF::Utils
calcTPSA() :
RDKit::Descriptors
calculateCosTorsion() :
ForceFields::UFF::Utils
calculateCosY() :
ForceFields::UFF::Utils
calcUnscaledVdWMinimum() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcUnscaledVdWWellDepth() :
ForceFields::MMFF::Utils
calcVdWEnergy() :
ForceFields::MMFF::Utils
canonicalizeConformer() :
MolTransforms
canonicalizeFragment() :
RDKit::Canon
canonicalizeMol() :
MolTransforms
CF_ALL :
RDKit::MolHash
CF_ATOM_ALL :
RDKit::MolHash
CF_ATOM_AROMATIC :
RDKit::MolHash
CF_ATOM_CHIRALITY :
RDKit::MolHash
CF_BOND_ALL :
RDKit::MolHash
CF_BOND_AROMATIZATION :
RDKit::MolHash
CF_BOND_CHIRALITY :
RDKit::MolHash
CF_BOND_IN_RING :
RDKit::MolHash
CF_BOND_ORDER :
RDKit::MolHash
CF_BOND_TYPE_EXACT :
RDKit::MolHash
CF_CHARGE :
RDKit::MolHash
CF_ELEMENT :
RDKit::MolHash
CF_ISOTOPE :
RDKit::MolHash
CF_NO_LABELS :
RDKit::MolHash
CF_VALENCE :
RDKit::MolHash
char_widths :
RDKit::MolDraw2D_detail
ChemicalReactionToRxnBlock() :
RDKit
ChemicalReactionToRxnMol() :
RDKit
ChemicalReactionToRxnSmarts() :
RDKit
ChemicalReactionToRxnSmiles() :
RDKit
chi0nVersion :
RDKit::Descriptors
chi0vVersion :
RDKit::Descriptors
chi1nVersion :
RDKit::Descriptors
chi1vVersion :
RDKit::Descriptors
chi2nVersion :
RDKit::Descriptors
chi2vVersion :
RDKit::Descriptors
chi3nVersion :
RDKit::Descriptors
chi3vVersion :
RDKit::Descriptors
chi4nVersion :
RDKit::Descriptors
chi4vVersion :
RDKit::Descriptors
chiNnVersion :
RDKit::Descriptors
chiNvVersion :
RDKit::Descriptors
chiralAtomCompat() :
RDKit
chiralRankMolAtoms() :
RDKit::Canon
ChiralSetPtr :
DistGeom
ChiSquare() :
RDInfoTheory
ci_ATOM_HOLDER :
RDKit
ci_LEADING_BOND :
RDKit
ci_RIGHTMOST_ATOM :
RDKit
cleanUp() :
RDKit::MolOps
CleanupAfterParseError() :
RDKit::SLNParse
,
SmilesParseOps
CleanupAfterParsing() :
SmilesParseOps
cleanupChirality() :
RDKit::MolOps
ClearSingleBondDirFlags() :
RDKit
clipToOne() :
ForceFields::MMFF
,
ForceFields::UFF
CloseMolRings() :
SmilesParseOps
closeRingBond() :
RDKit::SLNParse
CodeFlags :
RDKit::MolHash
codeSize :
RDKit::AtomPairs
COLLISION_THRES :
RDDepict
combineMols() :
RDKit
COMPOSITE_AND :
Queries
COMPOSITE_OR :
Queries
COMPOSITE_XOR :
Queries
CompositeQueryType :
Queries
compute13Dist() :
RDGeom
compute14Dist3D() :
RDGeom
compute14DistCis() :
RDGeom
compute14DistTrans() :
RDGeom
compute2DCoords() :
RDDepict
compute2DCoordsForReaction() :
RDDepict
compute2DCoordsMimicDistMat() :
RDDepict
computeAngle() :
RDDepict
computeBalabanJ() :
RDKit::MolOps
computeBisectPoint() :
RDDepict
computeCanonicalTransform() :
MolTransforms
computeCentroid() :
MolTransforms
computeConfBox() :
RDKit::MolShapes
computeConfDimsAndOffset() :
RDKit::MolShapes
computeCovarianceMatrix() :
MolTransforms
computeDihedralAngle() :
RDGeom
computedPropName :
detail
computeGasteigerCharges() :
RDKit
computeGridCentroid() :
RDGeom
computeInitialCoords() :
DistGeom
computeIntVectPrimesProduct() :
RDKit
computeL1Norm() :
RDKit
computeNormal() :
RDDepict
computeRandomCoords() :
DistGeom
computeSignedDihedralAngle() :
RDGeom
computeSubAngle() :
RDDepict
computeUnionBox() :
RDKit::MolShapes
CONFORMER_SPTR :
RDKit
ConnectTheDots() :
RDKit
CONSTANT :
RDKit::MMFF
ConstAtomPtr :
RDKit
ConstBondPtr :
RDKit
constructBRICSAtomTypes() :
RDKit::MolFragmenter
constructBRICSBondTypes() :
RDKit::MolFragmenter
constructForceField() :
DistGeom
,
RDKit::MMFF
,
RDKit::UFF
constructFragmenterAtomTypes() :
RDKit::MolFragmenter
constructFragmenterBondTypes() :
RDKit::MolFragmenter
ContribPtr :
ForceFields
ContribPtrVect :
ForceFields
convertToBonds() :
RingUtils
convertToString() :
RDKit::SLNParse
CORINA :
RDKit
countAtomElec() :
RDKit::MolOps
countSwapsToInterconvert() :
RDKit
CreateSinglePartition() :
RDKit::Canon
crippenVersion :
RDKit::Descriptors
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