RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
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Class Index
A
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O
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P
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Q
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R
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S
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T
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U
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V
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X
A
EmbeddedAtom
(
RDDepict
)
Matrix
(
RDNumeric
)
MolSupplier
(
RDKit
)
SpecialSymmetryAtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
EmbeddedFrag
(
RDDepict
)
MaximumCommonSubgraph
(
RDKit::FMCS
)
MolWriter
(
RDKit
)
SquareMatrix
(
RDNumeric
)
AndQuery
(
Queries
)
EqualityQuery
(
Queries
)
MaxMinPicker
(
RDPickers
)
N
StretchBendContrib
(
ForceFields::MMFF
)
AngleBendContrib
(
ForceFields::MMFF
)
ExecStatistics
(
RDKit::FMCS
)
MCSAtomCompareParameters
(
RDKit
)
SubstructureCache
(
RDKit::FMCS
)
AngleBendContrib
(
ForceFields::UFF
)
ExplicitBitVect
MCSBondCompareParameters
(
RDKit
)
NewBond
(
RDKit::FMCS
)
SymmMatrix
(
RDNumeric
)
AngleConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
ExplicitFeature
(
RDFeatures
)
MCSParameters
(
RDKit
)
O
T
AngleConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
F
MCSProgressData
(
RDKit
)
AromaticAtomIterator_
(
RDKit
)
MCSResult
(
RDKit
)
O3A
(
RDKit::MolAlign
)
Target
(
RDKit::FMCS
)
Atom
(
RDKit
)
FeatureFileParseException
(
RDKit
)
MetricMatrixCalc
(
RDDataManip
)
O3AConstraint
(
RDKit::MolAlign
)
TargetMatch
(
RDKit::FMCS
)
AtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
FileParseException
(
RDKit
)
MMFFAngle
(
ForceFields::MMFF
)
O3AConstraintVect
(
RDKit::MolAlign
)
TArray2D
(
RDKit::FMCS
)
AtomicParams
(
ForceFields::UFF
)
ForceField
(
ForceFields
)
MMFFAngleCollection
(
ForceFields::MMFF
)
O3AFuncData
(
RDKit::MolAlign
)
TDTMolSupplier
(
RDKit
)
AtomIterator_
(
RDKit
)
ForceFieldContrib
(
ForceFields
)
MMFFAromCollection
(
ForceFields::MMFF
)
OopBendContrib
(
ForceFields::MMFF
)
TDTWriter
(
RDKit
)
AtomMonomerInfo
(
RDKit
)
ForwardSDMolSupplier
(
RDKit
)
MMFFAtomProperties
(
RDKit::MMFF
)
OrQuery
(
Queries
)
DuplicatedSeedCache::TKey
(
RDKit::FMCS
)
AtomPDBResidueInfo
(
RDKit
)
FourthDimContrib
(
DistGeom
)
MMFFBndkCollection
(
ForceFields::MMFF
)
P
TorsionAngleContrib
(
ForceFields::MMFF
)
AtomRingQuery
(
RDKit
)
FragCatalogEntry
(
RDKit
)
MMFFBond
(
ForceFields::MMFF
)
TorsionAngleContrib
(
ForceFields::UFF
)
AttribType
(
RDKit::SLNParse
)
FragCatGenerator
(
RDKit
)
MMFFBondCollection
(
ForceFields::MMFF
)
ParamCollection
(
ForceFields::UFF
)
TorsionConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
B
FragCatParams
(
RDKit
)
MMFFChg
(
ForceFields::MMFF
)
PDBMolSupplier
(
RDKit
)
TorsionConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
FragFPGenerator
(
RDKit
)
MMFFChgCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PDBWriter
(
RDKit
)
Transform2D
(
RDGeom
)
BadFileException
(
RDKit
)
FragmenterBondType
(
RDKit::MolFragmenter
)
MMFFCovRadPauEle
(
ForceFields::MMFF
)
PeriodicTable
(
RDKit
)
Transform3D
(
RDGeom
)
BitCorrMatGenerator
(
RDInfoTheory
)
FreeChemicalFeature
(
ChemicalFeatures
)
MMFFCovRadPauEleCollection
(
ForceFields::MMFF
)
Point
(
RDGeom
)
U
BitVect
G
MMFFDef
(
ForceFields::MMFF
)
Point2D
(
RDGeom
)
Bond
(
RDKit
)
MMFFDefCollection
(
ForceFields::MMFF
)
Point3D
(
RDGeom
)
UFFAngle
(
ForceFields::UFF
)
BondIterator_
(
RDKit
)
GasteigerParams
(
RDKit
)
MMFFDfsbCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PointND
(
RDGeom
)
UFFBond
(
ForceFields::UFF
)
BondStretchContrib
(
ForceFields::MMFF
)
Graph
(
RDKit::FMCS
)
MMFFHerschbachLaurie
(
ForceFields::MMFF
)
PositionConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
UFFInv
(
ForceFields::UFF
)
BondStretchContrib
(
ForceFields::UFF
)
GreaterEqualQuery
(
Queries
)
MMFFHerschbachLaurieCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PositionConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
UFFTor
(
ForceFields::UFF
)
BoundsMatrix
(
DistGeom
)
GreaterQuery
(
Queries
)
MMFFMolProperties
(
RDKit::MMFF
)
PySequenceHolder
UFFVdW
(
ForceFields::UFF
)
C
Grid3D
(
RDGeom
)
MMFFOop
(
ForceFields::MMFF
)
Q
UniformGrid3D
(
RDGeom
)
GridException
(
RDGeom
)
MMFFOopCollection
(
ForceFields::MMFF
)
V
Catalog
(
RDCatalog
)
H
MMFFPBCI
(
ForceFields::MMFF
)
Query
(
Queries
)
CatalogEntry
(
RDCatalog
)
MMFFPBCICollection
(
ForceFields::MMFF
)
QueryAtom
(
RDKit
)
ValueErrorException
CatalogParams
(
RDCatalog
)
SubstructureCache::HashKey
(
RDKit::FMCS
)
MMFFProp
(
ForceFields::MMFF
)
QueryAtomIterator_
(
RDKit
)
VdWContrib
(
ForceFields::MMFF
)
ChemicalFeature
(
ChemicalFeatures
)
HashSet
(
RDKit::MolHash
)
MMFFPropCollection
(
ForceFields::MMFF
)
QueryBond
(
RDKit
)
Vector
(
RDNumeric
)
ChemicalReaction
(
RDKit
)
HasPropQuery
(
RDKit
)
MMFFStbn
(
ForceFields::MMFF
)
R
X
ChemicalReactionException
(
RDKit
)
HasPropWithValueQuery
(
RDKit
)
MMFFStbnCollection
(
ForceFields::MMFF
)
ChemicalReactionParserException
(
RDKit
)
HasPropWithValueQuery< TargetPtr, std::string >
(
RDKit
)
MMFFTor
(
ForceFields::MMFF
)
RangeQuery
(
Queries
)
XOrQuery
(
Queries
)
ChiralAtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
HeteroatomIterator_
(
RDKit
)
MMFFTorCollection
(
ForceFields::MMFF
)
ReactionFingerprintParams
(
RDKit
)
a
ChiralSet
(
DistGeom
)
HierarchCatalog
(
RDCatalog
)
MMFFVdW
(
ForceFields::MMFF
)
ReactionPickler
(
RDKit
)
ChiralViolationContrib
(
DistGeom
)
HierarchicalClusterPicker
(
RDPickers
)
MMFFVdWCollection
(
ForceFields::MMFF
)
ReactionPicklerException
(
RDKit
)
argless
(
Rankers
)
Composition2N
(
RDKit::FMCS
)
I
MMFFVdWRijstarEps
(
ForceFields::MMFF
)
RecursiveStructureQuery
(
RDKit
)
atomicData
(
RDKit
)
Conformer
(
RDKit
)
MolAlignException
(
RDKit::MolAlign
)
RingInfo
(
RDKit
)
b
ConformerException
(
RDKit
)
ImplicitFeature
(
RDFeatures
)
MolCatalogEntry
(
RDKit
)
RingMatchTableSet
(
RDKit::FMCS
)
ConstBondIterator_
(
RDKit
)
IndexErrorException
MolCatalogParams
(
RDKit
)
ROMol
(
RDKit
)
bondholder
(
RDKit::Canon
)
CrippenParamCollection
(
RDKit::Descriptors
)
InfoBitRanker
(
RDInfoTheory
)
MolChemicalFeature
(
RDKit
)
RWMol
(
RDKit
)
c
CrippenParams
(
RDKit::Descriptors
)
Int2Type
(
Queries
)
MolChemicalFeatureDef
(
RDKit
)
S
D
Invariant
(
Invar
)
MolChemicalFeatureFactory
(
RDKit
)
canon_atom
(
RDKit::Canon
)
InversionContrib
(
ForceFields::UFF
)
MolDraw2D
(
RDKit
)
SDM
(
RDKit::MolAlign
)
charptr_functor
(
RDKit
)
DatastructsException
K
MolDraw2DCairo
(
RDKit
)
SDMolSupplier
(
RDKit
)
g
Dict
(
RDKit
)
MolDraw2DQt
(
RDKit
)
SDWriter
(
RDKit
)
DiscreteDistMat
(
RDKit
)
KeyErrorException
MolDraw2DSVG
(
RDKit
)
Seed
(
RDKit::FMCS
)
gtIIPair
(
RDDepict
)
DiscreteValueVect
(
RDKit
)
SubstructureCache::KeyNumericMetrics
(
RDKit::FMCS
)
MolDraw2Dwx
(
RDKit
)
SeedSet
(
RDKit::FMCS
)
i
DistanceConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
L
MolDrawOptions
(
RDKit
)
SetQuery
(
Queries
)
DistanceConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
MolFragment
(
RDKit::FMCS
)
SLNParseException
(
RDKit
)
streambuf::istream
(
boost_adaptbx::python
)
DistPicker
(
RDPickers
)
LAP
(
RDKit::MolAlign
)
MolHistogram
(
RDKit::MolAlign
)
SmilesMolSupplier
(
RDKit
)
l
DistViolationContrib
(
DistGeom
)
LessEqualQuery
(
Queries
)
MolPickler
(
RDKit
)
SmilesParseException
(
RDKit
)
DuplicatedSeedCache
(
RDKit::FMCS
)
LessQuery
(
Queries
)
MolPicklerException
(
RDKit
)
SmilesWriter
(
RDKit
)
larger_of
(
RDKit
)
E
LinearCatalog
(
RDCatalog
)
MolSanitizeException
(
RDKit
)
SparseBitVect
ltDouble
(
RDKit
)
LocaleSwitcher
(
RDKit::Utils
)
MolStackElem
(
RDKit::Canon
)
SparseIntVect
(
RDKit
)
o
EleContrib
(
ForceFields::MMFF
)
M
MolStackUnion
(
RDKit::Canon
)
SpecialChiralityAtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
streambuf::ostream
(
boost_adaptbx::python
)
MatchingAtomIterator_
(
RDKit
)
A
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B
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C
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D
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E
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F
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G
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H
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K
|
L
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M
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O
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P
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R
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S
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T
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U
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V
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X
Generated on Sat Apr 23 2016 18:49:15 for RDKit by
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