libpappsomspp
Library for mass spectrometry
Class Index
a | b | c | d | e | f | g | i | l | m | o | p | q | r | s | t | u | x
  a  
FilterMorphoMean (pappso)    MassSpecTracePlotWidget (pappso)    PeptideFixedModificationBuilder (pappso)   
  t  
FilterMorphoMedian (pappso)    MassSpectrum (pappso)    PeptideFragment (pappso)   
Aa (pappso)    FilterMorphoMin (pappso)    MassSpectrumCombiner (pappso)    PeptideFragmentIon (pappso)    TandemWrapperRun (pappso)   
AaBase (pappso)    FilterMorphoMinMax (pappso)    MassSpectrumCombinerFactory (pappso)    PeptideFragmentIonListBase (pappso)    TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget (pappso)   
AaModification (pappso)    FilterMorphoSum (pappso)    MassSpectrumFilterGreatestItensities (pappso)    PeptideInterface (pappso)    TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget (pappso)   
AtomNumberInterface (pappso)    FilterMorphoWindowBase (pappso)    MassSpectrumFilterInterface (pappso)    PeptideIsotopeSpectrumMatch (pappso)    TicXicChromTracePlotWidget (pappso)   
  b  
FilterOboPsiModSink (pappso)    MassSpectrumFilterResampleKeepMzRange (pappso)    PeptideMethioninRemove (pappso)    TimsBinDec (pappso)   
FilterOboPsiModTermAccession (pappso)    MassSpectrumFilterResampleRemoveMzRange (pappso)    PeptideModificatorBase (pappso)    TimsData (pappso)   
BaseColorMapPlotWidget (pappso)    FilterOboPsiModTermDiffMono (pappso)    MassSpectrumId (pappso)    PeptideModificatorInterface (pappso)    TimsDirectXicExtractor (pappso)   
BasePlotContext (pappso)    FilterOboPsiModTermLabel (pappso)    MassSpectrumMinusCombiner (pappso)    PeptideModificatorPipeline (pappso)    TimsFrame (pappso)   
BasePlotWidget (pappso)    FilterOboPsiModTermName (pappso)    MassSpectrumPlusCombiner (pappso)    PeptideModificatorTee (pappso)    TimsFrameBase (pappso)   
BaseTracePlotWidget (pappso)    FilterPseudoCentroid (pappso)    MassSpectrumWidget (pappso)    MsRunRetentionTime::PeptideMs2Point (pappso)    TimsMs2CentroidFilter (pappso)   
  c  
FilterResampleKeepGreater (pappso)    MgfOutput (pappso)    PeptideNaturalIsotope (pappso)    TimsMsFileReader (pappso)   
FilterResampleKeepSmaller (pappso)    MorpheusScore (pappso)    PeptideNaturalIsotopeAverage (pappso)    TimsMsRunReader (pappso)   
ColorMapPlotConfig (pappso)    FilterResampleKeepXRange (pappso)    MsFileAccessor (pappso)    PeptideNaturalIsotopeList (pappso)    TimsMsRunReaderMs2 (pappso)   
ContainsAny    FilterResampleRemoveXRange (pappso)    MsFileReader (pappso)    PeptideRawFragmentMasses (pappso)    TimsXic   
Convert2Dense (ralab::base::resample)    FilterRescaleY (pappso)    MsRunAlignment (pappso)    PeptideSemiEnzyme (pappso)    TimsXicExtractorInterface (pappso)   
  d  
FilterRoundY (pappso)    MsRunDataSetTree (pappso)    PeptideSinkInterface (pappso)    TimsXicStructure (pappso)   
FilterSavitzkyGolay (pappso)    MsRunDataSetTreeNode (pappso)    PeptideSizeFilter (pappso)    Trace (pappso)   
DaltonPrecision (pappso)    FilterScaleFactorY (pappso)    MsRunDataSetTreeNodeVisitorInterface (pappso)    PeptideSpectrumMatch (pappso)    TraceCombiner (pappso)   
DataPoint (pappso)    FilterSuite (pappso)    MsRunId (pappso)    PeptideSpSinkInterface (pappso)    TraceDetectionInterface (pappso)   
DriftSpecMassSpecColorMapPlotWidget (pappso)    FilterTandemDeisotope (pappso)    MsRunReader (pappso)    PeptideStrParser (pappso)    TraceDetectionMoulon (pappso)   
DriftSpecTracePlotWidget (pappso)    FilterTriangle (pappso)    MsRunReaderScanNumberMultiMap (pappso)    PeptideVariableModificationBuilder (pappso)    TraceDetectionSinkInterface (pappso)   
  e  
  g  
MsRunRetentionTime (pappso)    PeptideVariableModificationReplacement (pappso)    TraceDetectionZivy (pappso)   
MsRunRetentionTimeSeamarkPoint (pappso)    PpmPrecision (pappso)    TraceMinusCombiner (pappso)   
Enzyme (pappso)    GraphicDeviceWidget    MsRunSimpleStatistics (pappso)    PrecisionBase (pappso)    TracePeak (pappso)   
EnzymeProductInterface (pappso)    GrpExperiment (pappso)    MsRunSlice (pappso)    PrecisionFactory (pappso)    TracePlusCombiner (pappso)   
ExceptionNotFound (pappso)    GrpGroup (pappso)    MsRunXicExtractor (pappso)    PrecisionWidget (pappso)    MzxmlOutput::Translater (pappso)   
ExceptionNotImplemented (pappso)    GrpGroupingMonitor (pappso)    MsRunXicExtractorDisk (pappso)    Protein (pappso)   
  u  
ExceptionNotPossible (pappso)    GrpGroupingMonitorInterface (pappso)    MsRunXicExtractorDiskBuffer (pappso)    ProteinPeptideList   
ExceptionOutOfRange (pappso)    GrpMapPeptideToGroup (pappso)    MsRunXicExtractorFactory (pappso)    PwizMsFileReader (pappso)    Utils (pappso)   
  f  
GrpMapPeptideToSubGroupSet (pappso)    MsRunXicExtractorInterface (pappso)    PwizMsRunReader (pappso)   
  x  
GrpPeptide (pappso)    MsRunXicExtractorInterface::MsRunXicExtractorPoints (pappso)   
  q  
FastaFileIndexer (pappso)    GrpPeptideSet (pappso)    MsRunXicExtractorInterface::MsRunXicExtractorReadPoints (pappso)    Xic (pappso)   
FastaFileIndexerInterface (pappso)    GrpProtein (pappso)    MzPrecision (pappso)    QCPSpectrum (pappso)    TimsFrame::XicComputeStructure (pappso)   
FastaHandlerInterface (pappso)    GrpSubGroup (pappso)    MzRange (pappso)    QCPXic (pappso)    XicPeptideFragmentIon (pappso)   
FastaOutputStream (pappso)    GrpSubGroupSet (pappso)    MzxmlOutput (pappso)    QualifiedMassSpectrum (pappso)    XicPeptideFragmentIonNaturalIsotope (pappso)   
FastaReader (pappso)   
  i  
  o  
QualifiedXic (pappso)    XicPeptideInterface (pappso)   
FastaWriterInterface (pappso)   
  r  
XicWidget (pappso)   
FilterFloorY (pappso)    Ion (pappso)    OboPsiMod (pappso)    XtandemHyperscore (pappso)   
FilterGreatestY (pappso)    IonIsotopeRatioScore (pappso)    OboPsiModHandlerInterface (pappso)    ResPrecision (pappso)    XtandemHyperscoreBis (pappso)   
FilterHighPass (pappso)   
  l  
OboPsiModTerm (pappso)    RetentionTimeReader    XtandemInputSaxHandler (pappso)   
FilterHighPassPercentage (pappso)   
  p  
RtPoint (pappso)    XtandemOutputSaxHandler (pappso)   
FilterInterface (pappso)    LinearRegression (pappso)   
  s  
XtandemPresetSaxHandler (pappso)   
FilterLocalMaximum (pappso)    LocalMinPeakArea (ralab::base::ms)    PappsoException (pappso)    XtandemSpectrumProcess (pappso)   
FilterLowPass (pappso)   
  m  
PeakIonIsotopeMatch (pappso)    SavGolParams (pappso)    XyMsFileReader (pappso)   
FilterMorphoAntiSpike (pappso)    PeakIonMatch (pappso)    SimplePeakArea (ralab::base::ms)    XyMsRunReader (pappso)   
FilterMorphoBackground (pappso)    MapTrace (pappso)    PeakPicker (ralab::base::ms)    SimplePeakIonMatch (pappso)   
FilterMorphoMax (pappso)    MassDataCombinerInterface (pappso)    Peptide (pappso)    SimplePicker (ralab::base::ms)   
FilterMorphoMaxMin (pappso)    MassSpecTracePlotContext (pappso)    PeptideBuilder (pappso)    SpectrumCollectionHandlerInterface (pappso)   
a | b | c | d | e | f | g | i | l | m | o | p | q | r | s | t | u | x