Package org.jmol.util

Class ContactPair


  • public class ContactPair
    extends java.lang.Object
    • Field Detail

      • radii

        public float[] radii
      • vdws

        public float[] vdws
      • myAtoms

        public Atom[] myAtoms
      • pt

        public javajs.util.P3 pt
      • volume

        public double volume
      • vdwVolume

        public double vdwVolume
      • score

        public float score
      • d

        public float d
      • chord

        public float chord
      • contactType

        public int contactType
      • xVdwClash

        public float xVdwClash
      • oldType

        private int oldType
    • Constructor Detail

      • ContactPair

        public ContactPair​(Atom[] atoms,
                           int i1,
                           int i2,
                           float R,
                           float r,
                           float vdwA,
                           float vdwB)
    • Method Detail

      • getVolume

        private void getVolume()
      • setForVdwClash

        public boolean setForVdwClash​(boolean isVdw)
      • switchAtoms

        public void switchAtoms()
      • toString

        public java.lang.String toString()
        Overrides:
        toString in class java.lang.Object